Den typiska toxoplasmosbehandlingen är en sexveckorskur med ett antimalariamedicin och antibiotika, och olika behandlingar involverar bara olika mediciner. De flesta som har ett friskt immunförsvar vet inte att de är infekterade med toxoplasmos eftersom infektionen inte ger några symtom på en sjukdom. Om en person blir sjuk i toxoplasmos kommer han eller hon att utveckla influensaliknande symtom. Gravida kvinnor löper större risk att utveckla symtom på toxoplasmos och bör testas när en infektion misstänks. Medfödd toxoplasmos kan resultera i komplikationer för det ofödda barnet, så den blivande mamman kommer vanligtvis att börja med en antibiotikakur.
Vilken toxoplasmosbehandling som kommer att ordineras beror på om infektionen är akut eller latent. Båda typerna kräver användning av antimalariamedel och antibiotika för att förstöra patogenen som är ansvarig för att orsaka infektionen. Akut toxoplasmos avser en ny infektion och behandlas vanligtvis med en kombination av pyrmetamin och sulfadiazin. Gravida kvinnor behandlas med ett antibiotikum som kallas spirmycin, och användningen av detta antibiotikum hjälper till att förhindra att infektionen når barnet i livmodern. Efter att barnet är fött kan tester utföras för att avgöra om han eller hon har en aktiv infektion, och om barnet testar positivt kommer en treveckorscykel av pyrmetamin och sulfadiazin att börja.
Den antimalaria pyrmetamin kan bygga upp till toxiska nivåer i blodet när det tas i stora mängder under långa tidsperioder, så de flesta människor ordineras folinsyra för att förhindra toxicitet i blodet från att utvecklas. Pyrmetaminen kan också blockera absorptionen av folsyra och andra B-vitaminer, så läkare kommer att ordinera samma folinsyra som tas för att förhindra toxicitet för att hjälpa till att ersätta nivåerna av folsyra i kroppen. Två omgångar av dessa mediciner behövs ofta, med två veckors vila från medicinerna mellan behandlingsfaserna. Medicineringsregimen för toxoplasmosbehandling är nästan universell för alla patienter och är vanligtvis effektiv för att eliminera infektionen.
Toxoplasmosbehandling kan ta så lång tid som 12 veckors medicinering. Om infektionen är resistent mot de vanliga antimalaria- och antibiotikamedicinerna, blir det en latent infektion, och ytterligare behandling är nödvändig. Dessa mediciner ordineras ibland till immunhämmade patienter som den första raden av toxoplasmosbehandling. Atovakvon och klindamycin är två antibiotika som används för att döda toxoplasmoscystor när andra antibiotika misslyckas. Läkare kan behandla toxoplasmos framgångsrikt för det mesta utan några bestående konsekvenser, men vissa barn som är infekterade före födseln kan födas med milda komplikationer till följd av infektionen.