Några av de vanligaste biverkningarna av rotkanalen inkluderar smärta eller obehag, stoppad tandtillväxt och eventuell missfärgning och försvagning av tanden. Även om vissa av dessa biverkningar kräver ytterligare tandarbete, är de vanligtvis ofarliga och tyder sällan på rotkanalproblem. Andra biverkningar kan dock betyda att det fanns rotkanalskomplikationer. Dessa biverkningar inkluderar svår smärta, infektion och en sprucken tand. En tandläkare kanske kan vända dessa komplikationer, eller så kan patienten behöva opereras för att rädda tanden.
Den förmodligen vanligaste av rotfyllningsbiverkningarna är det milda till måttliga obehag eller smärta som en patient kan uppleva både under och efter ingreppet. Många patienter beskriver smärtan de upplever när de får en rotfyllning som liknar den typ av smärta som är vanlig med att få en vanlig tandfyllning. Eftersom patienter tenderar att uppleva en viss mängd vävnadsinflammation efter att ha fått en rotfyllning, kommer många att fortsätta att uppleva denna smärta under några dagar efter rotkanalen. Detta gäller särskilt om de redan hade smärta eller en infektion före proceduren. Tandläkare brukar rekommendera att hantera smärtan med receptfria smärtstillande mediciner tills den försvinner.
Ytterligare vanliga och icke-hotande biverkningar av en rotfyllning kan inkludera domningar i munnen och ansiktet eller en stickande känsla. Detta beror på bedövningen som används för att förhindra att patienten känner smärta under proceduren, och kommer att försvinna några timmar efter att ha lämnat tandläkarmottagningen. Om patienten är ett barn men tanden är permanent kan tanden sluta växa för gott. Vissa patienter får små sår eller blåsor på tandköttet nära tanden på grund av de bakterier som tidigare fanns i den infekterade tanden och pulpan, men dessa bör försvinna efter några dagar. Patienter kan också förvänta sig en viss nivå av missfärgning och svaghet i tänderna, även om dessa rotkanalsbiverkningar kanske inte visar sig på flera år efter proceduren.
Det finns allvarligare biverkningar som kan tyda på rotkanalskomplikationer. Dessa inkluderar svår smärta som inte svarar på receptfria smärtstillande mediciner eller bleknar under några dagar, en spricka i tanden eller någon annan typ av smärtsam eller ”avstängd” känsla som patienten kan ha relaterat till tanden som inte går bort. Varje patient som upplever denna typ av biverkningar bör se sin tandläkare så snart som möjligt, eftersom de kan vara symtom på vissa rotkanalproblem som en rotkanalinfektion. Vissa rotfyllningsproblem kan åtgärdas och tanden kan räddas genom en andra rotfyllning eller genom endodontisk kirurgi. Om besvären är tillräckligt allvarliga kan tandläkaren behöva dra ut tanden.
Om patienten tar hand om sin tand på rätt sätt kan den pågå resten av livet. Ändå kräver vissa rotfyllningsbiverkningar, som tandförsvagning och missfärgning, att tandläkaren och patienten tänker på framtida tandarbete. Till exempel kan en permanent fyllning på tanden hjälpa till att hålla den säker under lång tid. Att fästa en krona över tanden kan hjälpa tanden att hålla ännu längre, möjligen för evigt, samt dölja missfärgningen. Beroende på situationen är dessa överväganden som patienten och tandläkaren omedelbart kan diskutera eller kan spara till ett senare datum.