Det är möjligt för mögel att växa i områden där fukt och en matkälla finns. Metoderna som används för att rengöra mögel beror på flera faktorer, såsom angreppets svårighetsgrad och placering, de verktyg och rengöringsmedel som finns tillgängliga, vilken typ av yta som mögeln växer på och hur bekväm en individ är med att rengöra mögel. Att använda en lösning av tvättmedel och vatten eller blekmedel och vatten för att skrubba formen är ett sätt att rengöra mögel. Att använda ett högenergipartikelluftsvakuum (HEPA) för att avlägsna mögelsporer från luften är ett annat sätt att rengöra mögel.
Mögel som växer på porösa ytor som takplattor, mattor eller gipsskivor är vanligtvis svår att rengöra. Att rengöra mögel på dessa ytor är praktiskt taget omöjligt eftersom mögeln växer in i den porösa ytan. Att ta bort mögel och dess sporer från dessa ytor kan vara svårt, vilket gör utbyte till ett mycket bättre tillvägagångssätt.
Att rengöra mögel är generellt sett mer effektivt om mögel växer på en hård yta som golvplattor, ett glasfiberbadkar eller ett fönster. För mindre mögliga fläckar ska det drabbade området sprayas med en lösning av hälften milt ammoniakfritt rengöringsmedel och hälften vatten och sedan skrubba tills mögeln försvinner. Området bör sedan torkas helt. Användning av en avfuktare, fläkt eller luft från ett öppet fönster kan hjälpa till att påskynda torkningsprocessen.
När man rengör mögel på ett större område måste några extra steg vidtas för säkerheten och för att säkerställa att alla mögel- och mögelsporer tas bort. Området bör tätas av så bra som möjligt med plastfolie tejpad runt dörrar och fönster. En lösning av tvättmedel och vatten kan användas för att rengöra formen, eller en lösning av blekmedel och vatten kan vara mer önskvärt. En bleklösning gjord av åtta uns (0.24 liter) blekmedel tillsatt en gallon (3.8 liter) vatten desinficerar i allmänhet området bättre än tvättmedel och vatten enbart.
De drabbade områdena ska sprayas med lösningen och torkas rena. Om blekmedel används ska lösningen få sitta i 15 minuter. Efter att alla områden har rengjorts från synligt mögel och är torra, bör sporer avlägsnas från luften i rummet med hjälp av ett HEPA-vakuum. Efter att alla sporer har tagits bort från luften och formen har rengjorts från alla ytor är rummet säkert att öppna igen. Att hålla luften cirkulerande genom ett mögelutsatt område kan hjälpa till att förhindra framtida tillväxt.