Det finns olika typer av marsvinsproblem, av vilka några kan vara tillräckligt allvarliga för att kräva veterinärvård. Mag-tarmsjukdom är vanligt bland husdjursmarsvin, liksom pälsplockning. Hos vissa marsvin kan självstympning genom att plocka i päls och hud resultera i infektion. Detta kan bero på inaktivitet eller tristess, otillräcklig kost eller dåliga boendeförhållanden. Marsvinsproblem kan också involvera angrepp av kvalster, som kan överföras från en gnagare till en annan.
Marsvin är vanliga husdjur, och även om de tenderar att vara tåliga är de mottagliga för vissa åkommor. Ett av de vanligaste problemen med marsvin är uppblåsthet och diarré. Detta kan bero på bakterieinfektion eller parasiter. Oavsett orsak kan svår diarré hos ett marsvin leda till livshotande uttorkning. En oral hydreringslösning är nödvändig i ett sådant fall, och modifiering av kosten kan också rekommenderas.
När ett marsvins diet plötsligt ändras kan djuret sluta äta helt. Marsvinsproblem relaterade till anorexi kan också vara livshotande. Detta tillstånd är inte ovanligt hos marsvin, och snabb viktminskning kan vara dödlig om man inte söker ingripande. En veterinär kan rekommendera blodprover för att utesluta förekomst av sjukdom.
Det är inte ovanligt att problem med marsvin involverar tandproblem. Marsvin med övervuxna molarer kan drabbas av näringsbrister på grund av djurets ovilja att äta. I ett sådant fall kan veterinären finna det nödvändigt att trimma gnagarens tänder. Veterinärer använder speciella instrument för att undersöka och trimma marsvinets framtänder.
Djurägare som har äldre marsvin kan märka en illaluktande lukt från djurets rektala område. Detta kan bero på vad som kallas rektal inverkan på grund av mjuk avföring, ett tillstånd som är vanligt hos äldre gnagare. Mild rengöring kan hjälpa till att avlägsna fekalt material som omger rektalområdet. I vissa fall kan dock marsvinet behöva behandlas av en veterinär.
Luftvägssjukdomar som lunginflammation är vanliga hos äldre marsvin, eller djur med ett befintligt medicinskt tillstånd. Bakteriell lunginflammation kan vara dödlig om den inte behandlas omedelbart. När två eller flera marsvin hålls i en bur kan infektionen spridas snabbt bland gnagarna. Det är viktigt att desinficera burar och maträtter regelbundet för att förhindra spridning av sjukdomar bland husdjursmarsvin.