Missouris statliga flagga designades av Marie Elizabeth Oliver, som var hustru till senator Robert Burett Oliver. I de flesta fall tillskrivs idén att designa Missouris statliga flagga till en kommitté som skapades av den amerikanska revolutionens döttrar 1908. I nästan 92 år hade Missouri funnits som en inkorporerad stat utan en statlig flagga. Även om den färdiga Oliver-designen för statsflaggan fanns så tidigt som 1909, blev den inte den officiella statsflaggan förrän den 22 mars 1913.
Medan Oliver-flaggan var en favorit vid den tiden, fanns det en alternativ delstatsflagga i Missouri som allvarligt övervägdes av senaten. Denna flagga designades av Dr. GH Holcomb. Det är oklart om idén till en flagga var mycket populär bland Missourians, men det är dokumenterat att det tog flera försök att anta lagförslaget som utsåg Missouris officiella statsflagga. 1913 undertecknade guvernör Elliot Major slutligen lagförslaget, och flaggan blev officiell.
För att förstå varför Olivers förslag för Missouris delstatsflagga var framgångsrikt är det viktigt att överväga de egenskaper som önskas i en delstatsflagga. De flesta inblandade i detta projekt ansåg att den alternativa design som Holcomb föreslog inte tillräckligt representerade statens oberoende på grund av flaggans likhet med nationens. Oliver-flaggan var symboliskt rik, inklusive ett antal potenta bilder utan att vara för komplicerade att återge. Dessa bilder, inklusive stjärnor, en hjälm och björnar, valdes specifikt ut för att representera idéer och fakta om Missouri som ansågs vara mycket relevanta vid den tiden. Även om Missouris karaktär har förändrats under åren, är själva flaggan ett historiskt register över hur människor såg Missouri 1913.
Historien om Missouris statliga flagga slutar inte 1913, utan fortsätter snarare fram till idag. Under många år behöll familjen Oliver den ursprungliga flaggan som senatorns fru sytt, men 1961 donerades flaggan till staten. Den visades i många år tills skador på grund av ålder krävde förvaring för eget bevarande.
1988, 75-årsdagen av skapandet av flaggan inspirerade förnyat intresse för det ursprungliga föremålet. För att fira händelsen samlade grundskolestudenter i Missouri in pengar för att få flaggan återställd och visad igen. Med moderna arkiveringsmetoder och en hängivenhet för att bevara Missouris historia kommer flaggan sannolikt att finnas kvar på James C. Kirkpatrick State Information Center i Jefferson City, Missouri i många år.