Subjektiv perception är det sätt på vilket en individ ser den fysiska världen baserat på hur hans egen hjärna och sensoriska system fungerar. Varje individ har en hjärna, sensoriska system och kognitiva strukturer som skiljer sig från de som alla andra besitter. Som sådan kan man inte slutgiltigt säga att han hör eller ser exakt vad andra människor hör eller ser. Problemet med subjektiv uppfattning är mycket viktigt inom filosofi, hjärnvetenskap och psykologi, och är ett betydande hinder för att fastställa den avgörande objektiviteten hos vetenskapliga rön. Perception kan endast delas genom kommunikation, och det finns ingen form av kommunikation som perfekt kan uttrycka en persons uppfattning till en annan.
Ett vanligt diskuterat exempel på subjektiv uppfattning är frågan om huruvida varje person uppfattar färg på samma sätt eller inte. Många människor, även barn, kommer någon gång till insikten att de, utan att vara i någon annans sinne, inte kan veta om andra människor ser samma ”gula” som de gör. Ljusvågorna som når varje individs ögon är desamma, men man kan inte veta om ögonen och hjärnan bearbetar ljusvågorna på exakt samma sätt. De uppfattningar som två olika människor har av världen kan ha subtila skillnader eller kan variera dramatiskt. Perceptionens subjektiva natur gör det omöjligt att veta slutgiltigt.
För vissa är subjektiv uppfattning helt enkelt en intressant fråga att begrunda, men den är oerhört viktig för vetenskapen. Många vetenskapliga experiment är baserade på observationer, och icke-kvantitativa observationer är i allmänhet rotade i perception. Perception ger dock inte en ren representation av den fysiska världen, eftersom sensorisk input passerar genom perceptiva, neurologiska och kognitiva filter. Man kan inte ens med säkerhet veta att en persons filtrerade syn på världen är densamma som en annan persons. Detta väcker frågan om hur vetenskapen kan göra anspråk på att presentera objektiva rön om världen när dessa rön är baserade på subjektiv uppfattning.
Genom historien har många olika filosofer grubblat och skrivit om frågan om subjektiv uppfattning. Vissa hävdar att även om människor inte direkt kan känna till den fysiska världen, är mänsklig perception tillräcklig för att möjliggöra rimliga diskussioner och studier av den upplevda världen. Andra tar det till en extrem och hävdar att det inte finns någon objektiv yttre värld – eller åtminstone att den yttre världen är helt okän och att försök att utforska och förstå den är helt meningslöst.