Vad är algoritmisk botanik?

Som en disciplin som ägnar sig åt att använda virtuella medel för att öka kunskapsbanken om växter och växtliv, ger algoritmisk botanik botanikern användning av datorverktyg för att studera och simulera ett antal olika scenarier angående växter. Denna användning av virtuella verktyg för att studera virtuella växter har redan fått stor uppmärksamhet och är i fokus för en större studiekurs vid University of Calgary.

Processen för algoritmisk botanik uttrycks bäst som biologisk modellering och visualisering, mer populärt känd som BMV-metoden. Det är detta tillvägagångssätt som ligger till grund för den forskning som just nu bedrivs i regi av datavetenskapsavdelningen vid University of Calgary. I huvudsak utvecklas modeller inom algoritmisk botanik med hjälp av datavetenskaplig teknologi som kombineras med olika typer av mjukvara för att skapa ett virtuellt laboratorium där de virtuella växterna odlas under strikta och kontrollerade situationer. Möjligheten att köra ett antal olika simuleringar samtidigt hjälper till att påskynda forskningsprocessen en hel del. Algoritmisk botanik skapar en situation där botaniker är fria att utforska möjligheter inom en mycket kort tidsram, snarare än de år eller decennier som liknande ansträngningar skulle kräva under verkliga omständigheter.

BMV-grupperna av forskare vid University of Calgary är inte ensamma i sitt arbete. Personer från hela världen är involverade på olika nivåer i projektet. Arbetet är i princip uppdelat i tre huvudkomponenter. Modellering är grundkomponenten och innebär skapandet av grunden för de virtuella växterna. Simulering bygger på den grund som skapats av modelleringen och tillåter forskarna att introducera en rad kontrollerade faktorer i den virtuella miljön för varje modell. Visualiseringen av växterna gör det möjligt att studera den slutliga produkten som produceras av serien av faktorer som introduceras, vilket ger värdefull information om genomförbarheten och önskvärdheten av att använda dessa faktorer i en verklig tillämpning.

Under november 2007 samlades personer som var intresserade av framstegen inom algoritmisk botanik vid den femte årliga verkstaden för funktionell-strukturell växtmodellering. Workshopen hölls i Napier, Nya Zeeland, och var öppen för personer med anknytning till University of Calgary-projektet, såväl som oberoende forskare som använder någon form av algoritmisk botanik i sina ansträngningar.