Manliga och kvinnliga reproduktionssystem har utvecklats för olika specialiteter, men för samma mål: att producera barn. Hela en kvinnas reproduktionssystem finns inuti kroppen, medan mycket av en mans är utanför kroppen. Den funktionella skillnaden mellan de två systemen är att en kvinnas är utformad för att vårda ett barn medan det växer tillräckligt för att överleva i världen och en mans är ett leveranssystem för spermier. De enskilda komponenterna i systemen skiljer sig också åt.
Det reproduktiva systemet hos kvinnor är helt internt, med utgångs- och ingångspunkter vid slidan. En av de mest märkbara skillnaderna mellan män och kvinnor är de manliga könsorganen på utsidan av kroppen. De lägre temperaturerna i den yttre miljön hjälper till att hålla spermier friska och förhindra skador från de nivåer av värme som finns inuti kroppen.
En kvinna har separata öppningar för urin och för menstruation och samlag, medan mannen bara har en öppning för att släppa ut urin och sperma. Även om de yttre delarna av slidan tenderar att fyllas med blod under samlag, uppvisar en mans penis mycket mer uppenbar förstoring. Detta gör att han kan använda sin penis av funktionella skäl och föra in den i slidan.
Både det manliga och det kvinnliga reproduktionssystemet producerar hormoner, men hormonerna skiljer sig åt. Kvinnor producerar högre nivåer av kvinnliga hormoner som östrogen och män har till exempel mer testosteron. Dessa hormoner ger omfattande effekter på kroppen, såsom utvecklingen av sekundära sexuella egenskaper som bröst eller breda axlar. Båda reproduktionssystemen börjar producera ett ökande antal hormoner i puberteten.
Kvinnor har redan lagrade ägg i äggstockarna vid födseln, och äggen släpps ut varje månad. Män, å andra sidan, gör nya spermier regelbundet. Det kvinnliga reproduktionssystemet kräver en månatlig period för att förnya slemhinnan i livmodern, medan det manliga systemet inte kräver regelbundet underhåll på samma sätt.
Strukturellt är det kvinnliga reproduktionssystemet ett område för att hålla och vårda ett ofött barn. Dessutom är det ett utrymme där kvinnans ägg kan blandas med den manliga spermien för att producera en ny människa, vilket gör att kvinnan kan föra över några av sina gener till nästa generation och mannen att göra detsamma. Det manliga reproduktionssystemet innehåller ingen biologisk utrustning som kan stödja ett nytt barn. Istället är det ett produktions- och leveranssystem för spermier.