SYBR Green® adalah pewarna fluoresen yang mengikat DNA untai ganda dengan spesifisitas yang tinggi. Ini banyak digunakan dalam penelitian biologi molekuler untuk mengukur dan memvisualisasikan DNA untai ganda. SYBR Green® adalah pewarna sintetis, yang diperkenalkan pada awal 1990-an oleh Molecular Probes®, Inc., anak perusahaan Invitrogen&trade Corporation. Ini adalah pewarna sianin asimetris, sianin menjadi keluarga pewarna organik sintetis yang digunakan dalam fotografi, media CD-R dan DVD-R, dan dalam berbagai aplikasi penelitian biologi molekuler.
Beberapa fitur membuat SYBR Green® sangat berguna sebagai pewarna asam nukleat. Ini stabil pada kisaran suhu, yang berarti dapat digunakan untuk memantau reaksi biokimia yang terjadi pada suhu tinggi dan rendah. Ini mengikat secara non-kovalen ke permukaan DNA, yang berarti tidak akan mengganggu aktivitas sebagian besar nuklease dan DNA polimerase. Ini juga mengikat asam nukleat pada rentang linier dinamis hingga empat kali lipat, sehingga dapat memberikan kuantifikasi DNA yang akurat pada rentang konsentrasi yang luas.
Penggunaan laboratorium yang paling umum dari SYBR Green® adalah untuk mendeteksi DNA untai ganda secara real time polymerase chain reaction (PCR) dan dalam gel akrilamida. PCR adalah teknik untuk mengamplifikasi beberapa salinan DNA melalui siklus replikasi DNA yang berulang. PCR waktu nyata mengukur amplifikasi saat terjadi, dan karena SYBR Green® mengikat DNA untai ganda, mengukur emisi fluoresensi kompleks pewarna DNA memungkinkan peneliti untuk mengukur jumlah DNA yang diproduksi. Seiring dengan kemajuan siklus PCR, terjadi peningkatan fluoresensi sebanding dengan jumlah produk PCR yang dihasilkan.
Gel akrilamida ada di mana-mana di laboratorium biologi molekuler, karena mereka melayani tujuan umum yang dibutuhkan untuk memisahkan fragmen DNA berdasarkan ukuran. SYBR Green® memungkinkan peneliti untuk memvisualisasikan DNA dalam gel akrilamida dengan menyinari panjang gelombang yang sesuai di atasnya. Kegunaan lain dari SYBR Green® termasuk deteksi asam nukleat dalam larutan, dalam aplikasi biochip, dan dalam flow cytometry. Kompleks pewarna DNA menyerap cahaya biru pada 488 nm dan memancarkan cahaya hijau pada 522 nm.
SYBR Green® sangat sensitif; itu adalah 25 kali lebih sensitif daripada etidium bromida, pewarna lain yang umum digunakan untuk memvisualisasikan DNA. Afinitas tinggi SYBR Green® untuk DNA untai ganda membuatnya berguna untuk mendeteksi sampel DNA dengan jumlah salinan rendah. Ini secara istimewa mengikat DNA beruntai ganda, tetapi juga dapat mengikat DNA beruntai tunggal dengan fluoresensi berkurang. Seperti halnya molekul pengikat DNA, SYBR Green® dapat menyebabkan mutasi dan kemungkinan bersifat karsinogen. Namun, lebih aman untuk digunakan dan lebih mudah dibuang daripada etidium bromida.