Mikrobiologi medis adalah cabang dalam bidang mikrobiologi yang berfokus pada mikroorganisme kepentingan medis. Ahli mikrobiologi medis mempelajari organisme yang dapat menyebabkan penyakit pada manusia, melihat siklus hidup organisme tersebut, bagaimana mereka menyebabkan infeksi pada manusia, bagaimana mereka menyebar, apa yang mereka lakukan pada tubuh manusia, dan bagaimana mereka dapat diberantas. Orang-orang di bidang ini dapat bekerja di laboratorium penelitian yang mempelajari mikroorganisme, atau mereka dapat bekerja di laboratorium diagnostik, melakukan tes untuk mengidentifikasi organisme penyebab penyakit pada pasien dan membuat rekomendasi pengobatan.
Bakteri, jamur, protozoa, dan virus semuanya dapat menyebabkan penyakit pada manusia. Manusia telah dijajah oleh mikroorganisme sejak awal, dan mikroorganisme terus berkembang dan berubah untuk menggagalkan upaya manusia dalam mengendalikannya. Bidang mikrobiologi medis terlibat dengan mengidentifikasi mikroorganisme baru, memantau perubahan spesies yang bermutasi dengan cepat, dan menangani tantangan yang sedang berlangsung dalam mikrobiologi, mulai dari perkembangan resistensi terhadap antibiotik pada bakteri hingga kontaminasi pasokan air dengan protozoa.
Seperti peneliti mikrobiologi lainnya, ahli mikrobiologi medis tertarik untuk mengidentifikasi dan mengkategorikan organisme yang mereka lihat. Informasi ini dapat membantu orang melihat apa yang mereka hadapi, dan dapat membantu pengembangan perawatan. Memahami hubungan antara organisme juga bisa menjadi penting ketika peneliti mengeksplorasi metode penularan. Proses identifikasi juga dapat mencakup penyelidikan tentang asal usul dan sejarah suatu organisme; mempelajari di mana virus flu berkembang, misalnya, penting untuk memahami bagaimana epidemi terjadi.
Selain tertarik pada mikroorganisme itu sendiri, bidang mikrobiologi medis juga berkaitan dengan imunologi, melihat pertahanan manusia terhadap organisme tersebut dan bagaimana mereka dapat ditingkatkan atau didukung. Para peneliti juga mempelajari patologi, perjalanan penyakit dalam tubuh, dan epidemiologi, ilmu yang mempelajari bagaimana dan mengapa penyakit menyebar. Ahli mikrobiologi medis memiliki keterampilan yang dapat diterapkan pada wabah penyakit yang muncul, masalah berkelanjutan dengan mikroorganisme, dan berbagai tantangan medis lainnya.
Saat di sekolah kedokteran, banyak dokter menghabiskan waktu mempelajari mikrobiologi medis, dengan beberapa dokter menghabiskan lebih banyak waktu mempelajari subjek ini daripada yang lain. Memahami cara kerja mikroorganisme penting bagi dokter, karena pengetahuan ini dapat diterapkan untuk diagnosis dan pengobatan infeksi. Beberapa dokter mungkin terus fokus pada penelitian mikrobiologi medis, bekerja untuk mengembangkan metode baru memerangi mikroorganisme dan melakukan studi klinis untuk mengumpulkan informasi tentang obat baru, efektivitas protokol pengobatan yang diusulkan, dan masalah lainnya.