Perbedaan antara sintaksis dan morfologi adalah bahwa sintaksis berkaitan dengan struktur kalimat dan morfologi berkaitan dengan struktur kata. Dalam bahasa apa pun, ada aturan yang memandu cara kata-kata disatukan. Ini adalah aturan sintaks. Morfologi adalah studi tentang bagaimana kata-kata dibentuk dan dipahami dalam suatu bahasa. Baik sintaksis dan morfologi terkait dengan bagaimana makna diproduksi dengan bahasa.
Sintaks adalah konsep yang mengatur struktur kalimat. Urutan kata-kata yang disatukan memiliki pengaruh pada makna kalimat secara keseluruhan. Aturan sintaksis harus diikuti agar kalimat menjadi benar secara tata bahasa dan masuk akal bagi penutur bahasa. Inilah yang menentukan hal-hal seperti urutan subjek dan kata kerja, dan bagaimana kata sifat dan kata keterangan digunakan.
Morfologi adalah ilmu yang mempelajari tentang morfem yang merupakan satuan terkecil makna dalam suatu bahasa. Morfem dapat berupa satu kata utuh atau awalan atau sufiks yang dipahami untuk mengubah arti kata dan karena itu memiliki makna itu sendiri. Morfologi mencakup konsep infleksi dan derivasi, yang memungkinkan kata-kata dibuat jamak atau bentuk kata diubah. Studi morfologi mencoba untuk memahami bagaimana orang menggunakan dan memahami cara kerja kata-kata, dalam upaya untuk memahami perbedaan yang dibuat satu morfem dengan banyak kata dan bagaimana kata-kata berhubungan satu sama lain.
Sintaks dan morfologi keduanya penting untuk cara orang memperoleh makna dari bahasa, tetapi keduanya berbeda dalam sintaksis yang mengacu pada urutan dan penggunaan kata, dan morfologi mengacu pada bagian kata yang menciptakan makna. Misalnya, dimungkinkan untuk membuat kalimat yang secara tata bahasa benar, tetapi itu tidak masuk akal bagi penutur bahasa tersebut. Hal ini dimungkinkan karena sintaks hanya mengatur urutan kalimat dan bukan arti kata-kata di dalamnya. Di sisi lain, kombinasi kata mungkin masuk akal bila digunakan bersama-sama, tetapi kehilangan maknanya jika disusun ulang dengan cara yang melanggar aturan sintaksis. Sintaks dan morfologi berbeda tetapi saling bergantung.