Ada banyak metode yang dapat digunakan untuk membuat aplikasi prototipe, meskipun beberapa tips dapat membantu untuk mempermudah proses umum. Salah satu aspek terpenting yang terlibat dalam pembuatan aplikasi prototipe adalah mempertahankan fokus pada fakta bahwa program hanyalah prototipe, tidak peduli metodologi mana yang diikuti, karena dapat dengan mudah melupakan dan membuang waktu dan tenaga untuk mengkode elemen yang mungkin tidak akan pernah digunakan. Selama proses pengembangan prototipe, menggunakan semua perpustakaan yang tersedia dan alat pengembangan cepat dapat secara drastis mengurangi jumlah waktu yang diperlukan untuk memiliki aplikasi fungsional. Dalam beberapa situasi, akan lebih efektif untuk membuat prototipe dalam program lain, seperti spreadsheet dengan kemampuan skrip, sehingga fitur utama dan desain antarmuka atau sistem dapat ditampilkan tanpa harus membangun kerangka kerja sementara untuk aplikasi yang sebenarnya. .
Perangkap umum yang dapat ditemui selama pengembangan dan penyempurnaan aplikasi prototipe adalah kehilangan pandangan akan fakta bahwa program tersebut hanyalah sebuah prototipe. Kelas dalam prototipe tidak perlu diperpanjang atau generik dan, untuk sebagian besar, pemrograman bisa sangat santai tanpa optimasi untuk efisiensi, keterbacaan atau penggunaan memori. Dalam banyak kasus, prototipe akan dibuang ketika produk sebenarnya mulai dikodekan, jadi fitur seperti loader yang rumit, dukungan untuk input yang diperluas, dan bahkan pemeriksaan kesalahan tidak diperlukan. Satu aspek lainnya adalah bahwa aplikasi prototipe biasanya akan dijalankan dalam keadaan yang terkendali, sehingga tata letak dinamis untuk ukuran atau resolusi layar yang berbeda juga biasanya tidak diperlukan.
Aplikasi prototipe kemungkinan akan dibuang atau ditulis ulang sepenuhnya setelah perubahan dan persetujuan dibuat oleh klien, jadi menggunakan alat yang membantu mempercepat pengembangan adalah cara untuk mengembangkan aplikasi dengan cepat. Ini dapat mencakup perpustakaan dengan fungsi tingkat tinggi untuk elemen antarmuka pengguna grafis (GUI) dan bahkan bahasa visual tingkat tinggi yang memungkinkan elemen untuk disisipkan hanya dengan beberapa baris kode. Pemrograman tingkat rendah, bahkan jika itu yang akan digunakan aplikasi akhir, harus dihindari karena banyaknya pemrograman dan overhead desain yang diperlukan untuk beberapa tugas sederhana.
Beberapa alat khusus yang dapat membantu penerapan aplikasi prototipe adalah pembuat GUI yang berbasis visual, pembuat kode otomatis, dan bahkan program prototipe yang ada untuk entitas yang lebih kompleks seperti server bahasa kueri standar (SQL). Dalam hal aplikasi akhir akan menggunakan elemen yang sebagian besar non-visual dan tidak melibatkan banyak interaksi pengguna, menggunakan program seperti presentasi atau perancang slide, program spreadsheet, atau bahkan hanya mock-up kertas dari aplikasi bisa sesuai. Menggunakan alat yang membutuhkan sangat sedikit pengkodean dan perencanaan untuk pengembangan aplikasi prototipe membantu membuat perubahan dengan cepat saat diminta dan dapat mempersingkat jumlah waktu yang dihabiskan dalam fase pengembangan prototipe.