Ada dua jenis utama kontrol backhoe yang umum digunakan; berikut adalah layout yang ditentukan oleh Society of Automotive Engineers International (SAE) dan International Organization for Standardization (ISO). Dinamika kontrol setiap sistem hampir identik dengan satu-satunya perbedaan adalah kontrol untuk mengoperasikan lengan boom dan lengan gayung dicerminkan. Dalam istilah yang sangat umum, backhoe yang digunakan di Amerika Serikat lebih sering menggunakan set kontrol SAE, sementara ekskavator yang digunakan di tempat lain di dunia beroperasi dengan tata letak ISO. Banyak ekskavator dan backhoe menawarkan sistem kontrol yang dapat dialihkan antara tata letak SAE dan ISO, menyerahkan keputusan kepada preferensi operator.
Di kedua jenis kontrol backhoe, ada dua tuas, satu untuk masing-masing tangan operator. Umum untuk kedua sistem kontrol, gerakan kiri dan kanan dari tuas kiri mengontrol slew, atau rotasi, dari badan mesin. Demikian pula di kedua sistem, menggerakkan tuas kanan ke kiri dan kanan mengontrol rotasi vertikal, atau keriting, bucket atau aksesori yang terpasang.
Dalam gerakan maju dan mundur tuas tangan inilah kedua sistem kontrol berbeda. Menggunakan tata letak SAE, menggerakkan tuas kiri ke depan dan ke belakang mengontrol gerakan vertikal lengan gayung, sedangkan tuas kanan mengontrol gerakan vertikal lengan boom. Di bawah gaya kontrol backhoe ISO, operasi ini dibalik. Sebagai contoh metode kontrol ini, menggerakkan kedua tuas tangan ke depan menyebabkan lengan gayung terangkat dan lengan boom turun; tindakan ini memiliki efek meluruskan seluruh lengan excavator di depan mesin.
Selain kontrol backhoe tuas tangan, ada dua pedal kaki langsung di depan operator, yang digunakan untuk mengoperasikan track alat berat secara mandiri. Terlampir pada pedal kaki, biasanya, adalah dua tuas kontrol panjang yang memungkinkan trek dioperasikan dengan tangan jika diinginkan. Memindahkan kedua pedal menjauh dari operator menyebabkan kedua set trek bergerak ke arah depan; demikian pula, menggerakkan kedua pedal ke arah operator memiliki hasil yang berlawanan.
Untuk memutar mesin, operator dapat menggerakkan satu pedal ke arahnya sendiri dan pedal lainnya menjauh untuk bergerak di sekitar titik pusat mesin, sementara menggerakkan hanya salah satu pedal ke arah atau menjauh akan memutar mesin di sekitar posisi trek statis . Sebagai contoh, menggerakkan pedal kiri ke arah operator dan pedal kanan menjauh akan menyebabkan track kiri bergerak mundur dan track kanan bergerak maju, membuat mesin berputar di sekitar poros tengahnya berlawanan arah jarum jam. Kontrol ini memungkinkan alat berat untuk bermanuver jauh lebih mudah daripada yang diperkirakan banyak orang.
Beberapa versi awal ekskavator backhoe menggunakan sistem tiga tuas yang sudah ketinggalan zaman, di mana tuas hanya bergerak dalam arah depan-ke-belakang dan secara terpisah mengontrol gerakan lengan gayung, lengan boom, dan sudut bucket. Kontrol backhoe ini lebih sering terlihat pada attachment backhoe di mana penggalian bukan merupakan fungsi utama alat berat dan pada ekskavator yang tidak berputar. Kursus pelatihan pengoperasian backhoe umumnya berkonsentrasi pada variasi SAE dan ISO yang dijelaskan di atas.