Homocysteinnivåer i kroppen kan påverkas av många olika faktorer, vilket kan vara mycket viktigt, eftersom ökade nivåer är kända för att vara associerade med en ökad risk för blodproppar, hjärtinfarkt och stroke. Vissa genetiska störningar kan orsaka problem med nedbrytningen av homocystein, vilket gör att nivåerna stiger. Människor som inte får i sig tillräckligt av vissa B-vitaminer kan också ha förhöjda nivåer. Flera medicinska tillstånd inklusive sköldkörtel- och njursjukdomar kan påverka hur mycket av aminosyran man har, liksom vissa typer av mediciner. Hos kvinnor är ålder ofta en faktor, främst för att ändrade hormonnivåer kan orsaka förändringar i homocysteinnivåerna.
Personer med genetiska störningar som gör att mediatormolekylerna, som hjälper till att bryta ner homocystein, inte fungerar eller saknas, har i allmänhet förhöjda nivåer. Homocystinuri, ett allvarligt tillstånd som vanligtvis diagnostiseras i barndomen där mediatormolekylerna inte är närvarande, orsakar otaliga problem relaterade till de extremt höga homocysteinnivåerna i blodet. Ett lindrigare tillstånd är hyperhomocysteinemi, där mediatormolekylerna finns där men inte fungerar på optimala nivåer.
B-vitaminer spelar också en stor roll i en persons homocysteinnivåer. Folsyra, vitamin B6 och vitamin B12 är alla avgörande för nedbrytningen av homocystein, och brist på dem gör att nivåerna stiger. De som inte får i sig tillräckligt med dessa vitaminer i sin kost kan behöva ta ett tillskott eller äta mer mat som innehåller dem för att få tillbaka homocysteinnivåerna till det normala.
Vissa medicinska problem kan leda till ökade homocysteinnivåer. Minskad produktion av sköldkörtelhormon kan orsaka problemet, liksom njursjukdom. Hudstörningen psoriasis kan också vara skyldig.
Mediciner kan också orsaka fluktuationer i homocysteinnivåerna i en persons kropp. Att ta p-piller kan hjälpa till att sänka nivåerna, eftersom de ökar östrogennivåerna, vilket verkar påverka homocystein. Patienter som tar läkemedel mot epilepsi kan ha större mängder homocystein. Ett annat läkemedel som kan få nivåerna att stiga är metotrexat.
Kvinnor kan uppleva en förändring i homocysteinnivåerna under livets gång på grund av förändringar i östrogennivåerna. Gravida kvinnor upplever ofta att deras nivåer går ner, eftersom de har mer östrogen än vanligt. Äldre kvinnor som har gått igenom klimakteriet, när östrogennivåerna naturligt sjunker, ser vanligtvis sitt homocystein stiga. Att ta östrogentillskott kan hjälpa till att få ner dem.