Med tanke på förfarandets invasivitet är de flesta komplikationer av lumbalpunktion sällsynta. Den vanligaste komplikationen är huvudvärk, som uppstår hos cirka fyra av tio patienter med lumbalpunktion och som vanligtvis går över inom en vecka. Andra komplikationer är allvarligare men uppträder med mycket mindre frekvens. Hjärnhinneinflammation, nervrotsskada och långvarig ryggvärk är några av de möjliga, men sällsynta, komplikationer för lumbalpunktion.
Huvudvärken som uppstår efter en lumbalpunktion kallas postduralpunktionshuvudvärk. Dess orsaker är inte kända. Det förekommer oftare hos kvinnor än hos män och mer sällan hos både yngre och äldre patienter. Flera studier visar att valet av nål som används för lumbalpunktionen påverkar förekomsten av dessa typer av lumbalpunktionskomplikationer. Blyertsnålar, i motsats till avfasade nålar, verkar avsevärt minska förekomsten av postdural punkteringshuvudvärk.
Studier visar att varken sängläge eller liggandes under en längre tid förhindrar en postdural punkteringshuvudvärk. Oralt koffein ger en viss övergående lindring, men det är kortverkande och kommer inte att eliminera huvudvärken. Den mest effektiva behandlingen är ett epiduralt blodplåster. Plåstret appliceras efter punktering och ger lindring för upp till 98 procent av patienterna som upplever en postdural punkteringshuvudvärk.
Allvarliga komplikationer för lumbalpunktion inkluderar tonsillbråck, intrakraniell blödning och infektioner. Dessa typer av komplikationer är sällsynta. Vissa komplikationer förekommer oftare hos patienter vars hälsa eller tillstånd är nedsatt. Patienter med allvarliga befintliga medicinska tillstånd är mer benägna att utveckla farliga komplikationer till följd av lumbalpunkteringar.
Prover av cerebrospinalvätska erhålls från en lumbalpunktion. Denna vätska omger hjärnan och ryggmärgen. Undersökning av vätskan kan hjälpa till att diagnostisera sjukdomar som hjärnhinneinflammation, multipel skleros och hjärnblödning. Proceduren utförs ibland för att fastställa förändringar i cerebrospinaltrycket. Skillnaden i tryck före vätskeavlägsnande och efter vätskeavlägsnande kan hjälpa till att diagnostisera en hjärntumör eller infektion.
Neurologer eller annan utbildad medicinsk personal utför lumbalpunktioner. Ingreppet sker vanligtvis på nedre delen av ryggen. Läkare rengör först, steriliserar och bedövar ibland området runt den plats som valts för punkteringen. De sätter in en nål mellan kotorna och rör sig in i utrymmet som är fyllt med cerebrospinalvätska. När vätskan har dragits ut tar läkare bort nålen och täcker punkteringen med ett sterilt förband.