Mawar dapat mengembangkan penyakit yang menyebabkan kerusakan pada bunga dan dedaunan. Blackspot, Botrytis blight, dan powdery mildew adalah penyakit mawar umum yang disebabkan oleh jamur. Karat mawar, penyakit jamur lain, menyebabkan bintik-bintik merah seperti karat pada dedaunan. Mosaik mawar merupakan penyakit yang sering menyerang bunga mawar dan disebabkan oleh virus. Empedu mahkota adalah penyakit lain yang menyerang mawar di daerah batang kayunya.
Blackspot adalah salah satu penyakit mawar paling umum yang disebabkan oleh jamur. Jamur dapat tertidur sampai suhu tinggi bercampur dengan kelembaban menyebabkan jamur menyebar. Penyakit flek hitam menyebabkan lingkaran hitam pada dedaunan dan batang, dan diobati dengan menggunakan semprotan sabun antijamur.
Hawar Botrytis disebabkan oleh jamur yang menyerang kuncup bunga yang sedang berkembang. Mawar yang terinfeksi penyakit ini menjatuhkan tunas yang sedang berkembang sebelum waktunya dan tunas yang ada berubah menjadi coklat pada tanaman. Ketika mawar terinfeksi hawar Botrytis, semua bahan tanaman yang terinfeksi harus dibuang dan dimusnahkan.
Embun tepung juga menyerang mawar, menyebabkan daun dan kuncup yang sedang berkembang menjadi layu dan berubah warna. Memangkas bahan yang terinfeksi membantu mencegah penyebaran penyakit. Tahap awal penyakit dapat diobati dengan semprotan fungisida.
Penyakit mawar yang umum termasuk karat mawar juga. Penyakit ini disebabkan oleh infeksi jamur yang menghasilkan bercak seperti karat di bagian bawah daun mawar, dan deteksi dini dapat mencegah penyebaran penyakit ke bagian atas daun. Karat mawar dapat berhasil diobati dengan semprotan fungisida ketika ditangkap dan dirawat lebih awal.
Mosaik mawar adalah salah satu penyakit mawar yang paling umum disebabkan oleh virus. Virus menyerang dedaunan, menyebabkan perubahan warna kuning dan pertumbuhan terhambat. Mosaik mawar disebarkan dengan mencangkok tanaman yang terinfeksi ke tanaman yang tidak terinfeksi. Karena penyakit ini tidak menyebar dengan sendirinya dari tanaman ke tanaman, mawar dengan mosaik mawar dapat dibiarkan di kebun. Satu-satunya cara untuk menghilangkan penyakit ini adalah dengan membuang tanaman yang terinfeksi.
Penyakit lain yang disebut crown gall adalah salah satu penyakit mawar yang umum menyerang batang tanaman mawar. Hal ini disebabkan oleh bakteri yang menyerang mawar dan tanaman lain yang batangnya berkayu. Penyakit ini menyebar di antara tanaman melalui penggunaan gunting tanaman yang terinfeksi bakteri. Mawar dan tanaman berkayu lainnya cenderung mengembangkan empedu mahkota di area yang rusak atau di lokasi luka pemangkasan. Untuk mencegah penyebaran, gunting pemangkas harus disanitasi setelah mengerjakan tanaman yang terinfeksi.