Ada banyak penyebab batuk malam hari. Banyak di antaranya dapat menyebabkan batuk di siang hari, tetapi penyebab paling umum dari batuk malam hari adalah penyakit seperti pilek, virus, alergi, asma, dan infeksi bakteri pada saluran pernapasan dan sinus. Beberapa penyakit atau kondisi dari kelompok ini dikaitkan dengan batuk yang memburuk di malam hari. Faktor lain yang dapat menyebabkan batuk di malam hari termasuk obat atau penyakit tertentu seperti penyakit refluks gastrointestinal (GERD) dan gagal jantung kongestif (CHF).
Semua jenis sinus parah atau kemacetan saluran napas dapat memperburuk batuk di malam hari. Berbaring membuat dahak sulit mengalir, dan lendir dapat menumpuk di tenggorokan, merangsang batuk malam hari. Faktor-faktor lain seperti udara kering atau paparan alergen rumah juga dapat menyebabkan lebih banyak batuk. Sedikit meninggikan kepala dengan bantal tambahan untuk orang dewasa atau bantal di bawah kasur untuk anak-anak dapat membantu mengatasi masalah batuk berbasis gravitasi, dan menggunakan pelembap dan mencoba mengurangi alergen di rumah dapat meningkatkan kelembapan atau batuk berbasis alergi.
Beberapa infeksi terutama dicatat karena batuknya yang memburuk, dan keduanya paling sering terjadi pada anak-anak. Croup, yang dapat terjadi dengan banyak virus atau infeksi bakteri, menyebabkan batuk menggonggong seperti anjing laut yang mungkin dimulai beberapa jam setelah anak tidur. Batuk rejan atau pertusis juga cenderung memburuk di malam hari. Kondisi ini membaik seiring waktu, dan croup dapat merespons lingkungan yang lebih lembab.
Kondisi alergi seringkali dapat menyebabkan batuk malam hari yang tidak sering terjadi di siang hari. Hal ini dijelaskan oleh fakta bahwa banyak orang alergi terhadap barang-barang di rumah mereka, dan setelah keluar sepanjang hari, mereka pulang ke rumah dengan paparan alergen yang menyebabkan masalah sinus. Pada saat mereka siap untuk tidur, sinus dan saluran pernapasan mungkin sangat teriritasi, menyebabkan batuk malam hari. Di sisi lain, ketika orang meninggalkan rumah pada hari itu, gejalanya membaik. Asma, yang mungkin atau mungkin tidak disebabkan oleh alergi, adalah kondisi lain yang dapat ditandai dengan batuk malam hari.
Terkadang batuk malam hari tidak berhubungan dengan virus, infeksi bakteri, alergi atau asma. GERD adalah pelaku tambahan yang menyebabkan asam lambung mengalir kembali ke kerongkongan. Iritasi ini dapat membuat hidung meler terus-menerus, dan pada beberapa orang menyebabkan batuk yang memburuk di malam hari, sebagian karena gravitasi. Gagal jantung kongestif, di mana fungsi jantung menurun, memiliki batuk yang memburuk saat berbaring sebagai gejala utama. Bila tidak ada penyebab batuk yang jelas, orang harus mendapatkan bantuan medis untuk menyingkirkan kondisi seperti asma, GERD, dan CHF.
Penyebab lain batuk malam hari adalah obat-obatan tertentu yang digunakan untuk mengobati gagal jantung dan tekanan darah tinggi. Secara khusus, ACE inhibitor seperti captopril, lisinopril, dan enalapril sering memicu batuk yang mungkin paling aktif di malam hari. Jika ini mengganggu tidur, ada antihipertensi lain yang bisa dicoba.