Pemeriksa medis penerbangan melakukan pemeriksaan fisik pada pengendali lalu lintas udara potensial atau saat ini dan pilot untuk membantu dalam menentukan apakah mereka layak untuk melakukan tugas yang diminta dari mereka. Pemeriksaan fisik termasuk memperoleh riwayat medis terperinci dan menentukan apakah pasien memiliki masalah kesehatan yang dapat menghambat kinerjanya atau membahayakan orang lain. Pemeriksa medis penerbangan kemudian menyerahkan informasi ini, bersama dengan rekomendasi, ke dewan sertifikat medis. Seseorang dapat melakukan tugas ini sebagai bagian dari praktik regulernya, atau bekerja untuk maskapai penerbangan, bandara, atau program pelatihan pilot dalam hubungannya dengan praktik klinis regulernya.
Bagian pertama dari pekerjaan pemeriksa medis adalah mendapatkan riwayat medis lengkap dari pasien. Ini termasuk meminta riwayat dari dokter perawatan primer pasien dan menanyai pasien selama pemeriksaan. Informasi yang diperlukan biasanya mencakup riwayat keluarga masalah kesehatan genetik, masalah jantung, dan masalah medis lainnya yang mungkin telah diteruskan ke pasien. Pemeriksa medis penerbangan juga harus memperoleh informasi dari pasien tentang masalah kesehatannya di masa lalu, kondisi kesehatannya saat ini, dan informasi tentang pengobatan saat ini.
Pemeriksaan fisik pasien juga merupakan bagian dari menjadi pemeriksa medis penerbangan. Selama bagian pekerjaan ini, dokter akan menguji rentang gerak pasien, mendengarkan detak jantungnya, dan memeriksa refleks. Tes penglihatan terperinci, yang memeriksa penglihatan pasien dan penglihatan tepi, juga dilakukan.
Setelah semua informasi yang diperlukan dikumpulkan, pemeriksa medis penerbangan kemudian mengatur informasi tersebut sesuai dengan pedoman lembaga penerbit dan menyerahkannya atas nama pasien ke lembaga tersebut. Berdasarkan pelatihan pemeriksa medis penerbangan, dokter biasanya akan memasukkan informasi apakah pasien memenuhi semua persyaratan untuk kelas sertifikat medis yang dia minta. Dalam banyak kasus, pemeriksa juga akan memberikan salinan laporannya kepada pasien.
Di sebagian besar negara, pemeriksa medis penerbangan diharuskan untuk mempertahankan praktik kedokteran klinis saat melakukan pemeriksaan untuk pilot dan pengontrol lalu lintas udara. Mayoritas pemeriksa medis penerbangan mempertahankan praktik reguler atau bekerja untuk praktik, dan memberikan layanan kepada masyarakat lokal yang ingin mendapatkan sertifikat medis. Dalam beberapa kasus, pemeriksa medis penerbangan akan mendapatkan kontrak dengan maskapai penerbangan atau sekolah pelatihan pilot dan memberikan pemeriksaan medis khusus bagi mereka yang bekerja untuk maskapai atau sekolah, atau calon pilot.