Seekor naga berjanggut betina hanya memiliki satu karakteristik yang pasti dapat membedakannya dari naga berjenggot jantan dari penampilannya. Ciri yang paling pasti dari naga berjenggot betina adalah tidak adanya tonjolan hemipenal, sedangkan naga berjenggot jantan akan memiliki dua tonjolan hemipenal. Namun, karakteristik jenis kelamin ini biasanya tidak terlihat pada naga tukik dan naga remaja muda, meskipun menjadi lebih mudah untuk menentukan jenis kelamin pada naga berjanggut dewasa.
Tonjolan hemipenal terletak di bawah ekor naga berjanggut jantan, di atas lubang perut. Pada jantan, tonjolan hemipenal akan terlihat di kedua sisi ekor. Betina kekurangan hemipen, tetapi akan ada sedikit tonjolan di tengah ekornya di atas bukaan perut. Meskipun ini adalah satu-satunya karakteristik untuk menentukan dengan pasti jenis kelamin naga berjanggut, ada karakteristik umum lain yang lebih umum pada pria daripada wanita, dan sebaliknya.
Salah satu karakteristik naga berjanggut adalah kemampuannya untuk membusungkan janggutnya dan mengubah janggutnya menjadi gelap. Betina dapat melakukan ini juga jika jantan, tetapi jantan umumnya lebih sering menunjukkan perilaku ini daripada betina, dan janggut jantan biasanya berubah warna menjadi lebih gelap daripada janggut naga betina. Naga itu membusungkan janggutnya dan mengubahnya menjadi gelap sebagai bagian dari rutinitas pacaran, ketika naga berjanggut merasa perlu untuk mempertahankan wilayahnya atau ketika naga berjanggut merasa terancam.
Ukuran naga berjenggot bukanlah karakteristik gender, meskipun naga berjanggut betina pada umumnya memiliki kepala yang lebih kecil daripada rekan laki-lakinya. Jantan sering memiliki ekor yang lebih tebal daripada betina, meskipun ini tidak dapat digunakan untuk menentukan jenis kelamin. Ekor naga berjanggut menebal seiring bertambahnya usia, jadi naga berjenggot betina yang lebih tua mungkin memiliki cerita yang lebih tebal daripada naga berjenggot jantan yang lebih muda.
Dalam banyak kasus, naga berjanggut betina menunjukkan perilaku yang kurang agresif daripada naga berjanggut jantan, tetapi seperti karakteristik lainnya, ini tidak selalu benar. Naga berjenggot mencapai kematangan seksual semuda delapan bulan. Naga berjanggut betina akan menggali, mencoba membuat liang untuk bertelur. Bahkan jika seekor naga berjanggut betina tidak kawin, dia masih bisa bertelur, dengan sekitar 20 butir telur dalam satu genggaman. Namun, naga berjanggut jantan mungkin juga terlihat menggali liang, karena beberapa komodo juga menggali liang untuk tidur dan selama masa stres.