Bakterieklassificering är processen att särskilja typer av bakterier från varandra och gruppera dem enligt gemensamma egenskaper. Sådan klassificering görs inom ramen för det internationellt accepterade systemet för biologisk taxonomi, eller vetenskapen om att klassificera organismer. Ett antal saker tas i beaktande under bakterieklassificeringen, särskilt RNA-sekvenser, men inklusive form, biokemi och egenskaper hos det yttre membranet, bland annat.
Även om det finns olika åsikter om hur organismer ska klassificeras, delar det nuvarande rådande systemet upp allt liv i tre domäner. Bakterier utgör en av dessa domäner. De uppvisar en extrem grad av mångfald och utgör, till antal, en stor majoritet av de kända arterna och är i massa fler än alla flercelliga organismer på jorden. Bakterieklassificering kan vara svår på grund av ett antal faktorer, särskilt frånvaron av komplexa strukturer som finns i mer avancerade organismer, såväl som bakteriers tendens att överföra segment av DNA.
Bakteriologer använder ett antal tekniker vid bakterieklassificering. Form är det enklaste sättet att skilja bakterier åt, och dessa organismer kan uppvisa en mängd olika former inklusive stavar, spiraler och sfärer, bland andra. Form är dock inte nödvändigtvis en exklusiv egenskap, och bakterier som är grupperade i vitt skilda klassificeringar kan ha liknande former.
Andra morfologiska egenskaper, såsom storlek, kan variera avsevärt från art till art, och typiska grupperingar kan också hjälpa till med klassificeringen. Många arter tenderar att bilda grupper av individuella celler, som kan variera mycket i antal. Närvaron av externa strukturer, såsom små tentakelliknande konstruktioner som kallas flageller, kan också hjälpa till att skilja bakteriearter.
Ett annat nyckelverktyg i bakterieklassificering är ett test som kallas gramfärgningstestet, uppkallat efter en mikrobiolog från 19-talet. Detta test kvantifierar bakterier enligt tjockleken på deras yttre membran. Gramnegativa bakterier har ett mycket tunt membran och grampositiva bakterier har ett tjockare membran.
Faktorer som metabolism och andra biokemiska distinktioner är ett annat verktyg för bakterieklassificering. Bakterier metaboliserar en mängd olika föreningar, och den eller de speciella föreningar som används eller omvandlas av en specifik bakterie kan hjälpa till med dess identifiering och klassificering. Analys av andra biokemiska data kan också hjälpa denna process.
Framsteg inom molekylär analysteknik har gjort det möjligt för bakteriologer att differentiera bakterier efter skillnader i RNA, såväl som specifika gensekvenser. Ytterligare analys av den totala mängden individuella RNA- och DNA-proteiner och förhållandena i vilka de är närvarande tillhandahåller ytterligare ett sätt för klassificering. Genom att använda några eller alla av dessa tekniker och observerbara egenskaper kan bakteriologer klassificera bakterier efter art och gruppera liknande arter tillsammans.