Miljöbioteknik är ett område inom vetenskap och ingenjörskonst som använder organiska och levande system för att sanera miljöavfall, förhindra föroreningar genom utveckling av grön teknik och förbättra industriella processer som vid tillverkning av bioplaster och biobränslen genom enzymatiska åtgärder. Området för miljövetenskap och miljöteknik blir allt mer bredbaserat när industrier letar efter effektivare och mindre förorenande produktionsmetoder för att följa statliga regler. En av huvudarenorna som miljöbiotekniken fokuserar på från och med 2011 inkluderar sanering av gamla industriella föroreningar som t.ex. giftiga metallföroreningar av mark eller grundvatten. Fördelaktig kommersiell utveckling inkluderar biomining, biobränsle och bioplastproduktion och mikrobiell behandling av avloppsvattenströmmar.
Många moderna nationer har forskningscentra för miljöbioteknik som är både offentligt och privat finansierade för att främja miljövetenskaplig teknologi. Exempel på dessa är Environmental Biotechnology Cooperative Research Center (EBCRC) i Australien som är inriktat på industriell föroreningskontroll, och Center for Environmental Biotechnology (CEB) i USA som forskar om hydrologiska och mikrobiella system när de relaterar till frågor om klimatförändringar och miljösanering med hjälp av biologiska processer. Även om mycket av denna forskning traditionellt involverar biovetenskaperna mikrobiologi och jordbruksforskning, spelar kemiteknik också en allt viktigare roll inom området. Detta beror på det faktum att många syntetiska industriella föreningar är kända för att vara främlingsfientliga och ackumuleras i ekosystem och levande organismer eftersom de inte lätt bryts ned av naturliga processer över tid.
Bland de viktigaste miljötekniska lösningarna som erbjuds av forskning och utveckling inom miljöbioteknik är produktionen av avfallsbaserade råvaror. Råvaror är värdelösa material som produceras av en industriell process som kan få mervärde i en annan process istället för att vara en miljöförorening och avfallsprodukt både i material- och energikostnader. Utvecklingen av råmaterialsystem har undersökts mest för produktion av etanolbränsle och genom biprodukter som skapats inom pappersindustrin. Trämassa och barkavfall från papperstillverkning kan användas för att jäsa biobränslen, såväl som material som avfall från vegetabilisk olja (WVO) från kommersiella restaurangkedjor, grönt avfall från kommuner och skördeavfall från sockerrörs- och betproduktion.
Andra typer av råmaterial inkluderar majsstover, en avfallsmajsbiprodukt som kan användas för att skapa etanol, och sojabönstvål, en biprodukt av sojaoljaproduktion som kan användas för att skapa biodieselbränsle. Miljöbiotekniken syftar också till att utnyttja resurser och mark som inte direkt har något värde i livsmedelsproduktionen. Detta involverar odling av växter som växer bra med saltvattenbevattning i kustnära hav eller ökenregioner där typiska matgrödor inte kan överleva. Halofyterna, inklusive Salicornia bigelovii som är en art av dvärgsaltört, är exempel på växter som producerar biobränsleutbyten jämförbar med vad som kan göras av sojabönor och andra oljefröbaserade spannmål.