Vad är Nick Translation inom biologi?

Inom området biologi är nick translation en process som används för att ersätta vissa molekyler som utgör DNA-strängar med liknande molekyler som producerar en specifik, önskad egenskap, ofta en egenskap som gör att dessa molekyler lätt kan upptäckas och identifieras under ett experiment. Ett enzym känt som DNA-polymeras I gör att vissa DNA-molekyler, kända som nukleotider, ersätts med nya nukleotider. De nya nukleotiderna plockas specifikt av forskarna som utför experimentet.

Ofta används nick translation för vetenskapliga procedurer som blotting. Detta innebär att isolera och undersöka stammar av DNA för att bestämma vilka nukleotider den består av och sedan utföra experiment på den specifika DNA-strängen. Att lära sig om olika DNA-sekvenser kan hjälpa till att isolera en mutation eller skapa en antikropp för att bekämpa ett virus.

Processen med nick-translation involverar vad som kallas restriktionsenzymer som används för att göra snitt eller ”nicks” på DNA-sekvensen. Ett restriktionsenzym är utformat för att skära en DNA-sekvens på en specifik plats och är en typ av försvarsmekanism som används för att förstöra skadliga virus. Forskare använder restriktionsenzymet för att skära bitar av DNA så att de kan ersätta dem med nya bitar.

När hacken är gjorda används specifika enzymer för att reparera DNA:t med speciella nukleotider utformade för att göra det lättare att studera DNA. Forskare studerar denna nya DNA-sekvens för att se hur den reagerar på sig själv eller andra föremål, och att ha dessa taggade nukleotider förenklar processen att noggrant övervaka och studera DNA-strängen. Ett vanligt exempel är införandet av taggade nukleotider som kommer att lysa när de placeras under ett svart ljus, vilket gör dem lätta att upptäcka.

Ett annat vanligt exempel på en av de många användningarna av nick-translation är fluorescerande in situ-hybridisering. Denna process gör det möjligt för en forskare att leta efter specifika DNA-sekvenser för att se om de finns i en DNA-sträng eller inte. Nick-översättning kan ge dessa DNA-strängar fluorescerande egenskaper så att de lyser och vetenskapsmannen kan använda detta för att hjälpa till att identifiera vilka DNA-sekvenser som finns och vilka som saknas.

Nukleotider som tagits bort och sedan ersatts genom nick-translation kallas ofta för ”skräp-DNA”. Forskare har ännu inte kunnat hitta något slags syfte som dessa DNA-molekyler tjänar. De verkar vara icke-fungerande och bär inte koden för någon form av protein, vilket är typiskt för det mest användbara DNA.