Vad är en Kilobase?

En kilobas är ett numreringsmått som används inom genetikområdet. Eftersom en bas är en byggsten av genetisk information, och varje organism innehåller många baser, är 1,000 1,000 baser ett vanligt tal att använda när man diskuterar hur många baser en organisms genetiska bibliotek innehåller. Denna XNUMX XNUMX basbit kallas mer korrekt för en kilobas.
Varje levande organism innehåller genetisk information. Denna information förklarar för organismen exakt vilka proteinprodukter organismen behöver för att leva, växa och föröka sig. All genetisk information tillsammans kallas organismens genom.

Varje genom är uppdelat i diskreta sektioner. Dessa sektioner, kallade gener, kodar för en viss produkt. Varje gen innehåller en rad byggstenar, som kallas baser. När organismen läser generna för att producera en viss produkt, är det sekvensen av baser inuti genen som den läser.

Endast fyra baser finns i arvsmaterialet DNA. Dessa är cytosin (C), guanin (G), tymin (T) och adenin (A). Det är den ordning i vilken baserna är ordnade i en gen som dikterar vad den genen kodar för. Den komplexitet som krävs för att producera alla produkter som är nödvändiga för mänskligt liv beror på längden på generna och antalet baser inuti dem.

Alla gener innehåller ett anmärkningsvärt antal baser. Hela det mänskliga genomet, till exempel, innehåller 3 miljarder baser, var och en parad med en annan bas i en spiral helixstruktur. Den stora mängden baser som finns i ett genom gör att genetiker har lättare att hänvisa till gener som x kilobaser i längd, i motsats till 1,000 XNUMX gånger x längd.

Till och med de minsta genomen, som bakteriegenomet Carsonella ruddii, rymmer cirka 160,000 160 baspar. Detta lilla genom är cirka 3 kilobaser (kb) långt. Det mänskliga genomet är å andra sidan XNUMX miljoner kilobaspar långt.
Sekvensering av genom kräver att genomet bryts upp först. Utrustning som utför sekvenseringen kan bara hantera så många baser på en gång. Genetiker kan dela upp ett genom i många sektioner och hänvisa till dem som att de innehåller så många kilobaspar, till exempel en längd på 150 kilobaspar. Denna storlek av genetiskt material kan genetiskt modifieras till en annan organism för att multiplicera DNA upp till en nivå som är lätt att läsa. Även dessa relativt små bitar av DNA är för långa för att sekvensera direkt, så genetiker kan sedan bryta upp ett 150-kb segment i mycket mindre delar med några hundra baser långa.