Fotomikrografi är metoden att fotografera mikroskopiska föremål eller varelser, vanligtvis för vetenskapliga ändamål. Fotomikrografi används ofta i kriminaltekniska laboratorier och medicinsk forskning, såväl som andra områden som kräver studier av mikroskopiska detaljer. Under 19- och 20-talen togs mikrofotografier, även kallade mikrofotografier, genom att koppla ihop eller rikta in en filmkamera med ett mikroskop, en komplicerad process. Digital teknik har gjort det möjligt för de två enheterna att synkroniseras elektroniskt så att livebilder kan ses i realtid.
Fotomikrografi var pionjär på 1800-talet, bara några decennier efter introduktionen av själva fotografiet. Forskare insåg snabbt att fotomikrografi skulle underlätta studiet av cellstruktur, sjukdomsbakterier och annat mikroskopiskt material. När kriminalteknik kom till användning i brottsutredningar i början av 20-talet blev fotomikrografi ett viktigt verktyg för att undersöka spårbevis, små detaljer som kan koppla en misstänkt till en brottsplats.
Kamerazoomlinser och mikroskop fungerar på samma grundprincip: att använda förstoringslinser, och ibland speglar, för att förstora en punkt med bibehållen tydlig fokus. Tidig fotomikrografi involverade komplexa arrangemang av kameror och mikroskop. I vissa fall togs kamerans lins faktiskt bort, vilket gjorde att mikroskopet effektivt fungerade som dess lins. Digital teknik har eliminerat behovet av sådana noggranna anordningar; den mikroskopiska bilden bearbetas som digital data. Dessa data kan sparas på en dator, lagras som en stillbild eller video och förstoras på en skärm, allt medan objektet fortfarande är under mikroskopet.
Fotomikrografi kan vara mest känd i modern tid för dess användning vid bearbetning av spårbevis från brottsplatser. Spårbevis är resultatet av de mikroskopiska partiklar som produceras när två ämnen kommer i kontakt. Till exempel kommer en man som går över en matta att samla mattfibrer på sina skor, samt lämna små partiklar av smuts eller annat från skosulorna på själva mattan. Utredarna undersöker en brottsplats och kan använda mikrofotografi för att hitta dessa spårämnen och koppla dem till en misstänkt. Såvida inte spårbevis är särskilt starkt måste andra bevis skaffas för att fälla en misstänkt i domstol.
Fotomikrografi skildras ofta i tv-kriminalprogram som NCIS och Bones, även om det inte alltid är realistiskt. Fotomikrografi har också använts för att skapa konst. Fotografen och vetenskapsmannen Roman Vishniac visade ofta sina mikrofotografier vid sidan av sitt konstnärliga arbete, vilket inspirerade senare fotografer att söka bilder av mikroskopisk skönhet. En av Vishniacs mest revolutionerande bilder använde fotomikrografi för att skildra världen som den kan ses av en insekt med mångfacetterade ögon.