Japansk mytologi kretsar främst kring shinto-religionen och inkluderar tusentals gudar, gudinnor och andar. I själva verket, enligt shintotroen, har varje föremål i naturen, från den minsta stenen till det största trädet, sin egen ande; detta kan göra förståelsen av de viktigaste delarna av trossystemet lite överväldigande för lekmännen. Trots det stora antalet gudar i japansk mytologi spelar dock ett fåtal kärngudar en stor roll, inklusive Amaterasu, Hachiman och Susano.
I shinto-religionen kallas gudomarna för ”kami”. Termen är dock mer än bara ett namn på gudarna, den representerar också den livskraft som sägs flöda genom varje varelse och naturbit i världen. Efter döden blir mänskliga andar kami, och för att hedra detta begravs de mest inflytelserika medborgarna ofta i en av de många helgedomar som finns över hela Japan, så att de troendes hängivenhet kan nå dem.
Susano, stormarnas kami, är obönhörligt bunden till miljön i Japan. Japan är omgivet av vatten, och ibland kan det vattnet vara särskilt grovt, vilket ger vika för starka tyfoner och massiva tsunamier. Japan är en del av Stillahavsringen av eld, en term som används för att beskriva området utsatt för jordbävningar och vulkanutbrott. Susano anses ha lite omsorg om jorden och dess människor.
Amaterasu är sol- och fertilitetskami i japansk mytologi, och en av de viktigaste kami. Hon spelar en stor roll i att skapa ljuset som gör att risfälten, en av Japans primära grödor, kan växa varje säsong. Hennes barnbarn, Ninigi no Mikoto, sägs vara farfar till Jimmu Tenno, Japans första gudomliga kejsare. Medan en kejsare inte längre styr Japan, är kungafamiljens symboliska roll fortfarande mycket betydelsefull för nationen.
Hachiman är främst krigets och krigarnas kami, men han dyrkas också av de som arbetar inom fiske- och jordbruksindustrin. Samurajerna, en grupp vältränade och våldsamt lojala japanska krigare, vänder sig till Hachiman för skydd. Han är en av de mest populära gudarna i Japan, med tusentals helgedomar tillägnade honom i hela landet.
Japansk mytologi innehåller också många berättelser om onda andar, och majoriteten av de ritualer som utförs i landet är utformade för att hindra dessa andar från att orsaka skada. En populär ritual inträffar före nyårsdagen, när japanerna städar sina hem och använder en kvast för att sopa bort de onda andarna. Cederblad kan också placeras ovanför entrén till ett japanskt hem för att hålla borta Amazake-babaa, en äldre kvinna som orsakar sjukdomar till alla som svarar dörren när hon kommer och knackar på.