En intern organisationsstruktur är det särskilda sätt på vilket en organisation som ett företag, en välgörenhetsgrupp eller en skola är organiserad för att uppnå sina mål. Denna organisationsstruktur inkluderar tilldelning av uppgifter, övervakningsstruktur, hierarki och andra frågor som påverkar hur organisationen fungerar. Det kan variera beroende på organisationens natur och mål och kan också skilja sig beroende på de ansvarigas preferenser och ideal. Ett internt organisatoriskt struktursystem kan till exempel vara baserat på en strikt hierarkisk kontrollstruktur medan ett annat kan innebära mycket mindre tillsyn. Målet med den första är sannolikt stabilitet och effektivitet medan den andra sannolikt lägger tonvikten på kreativitet och flexibilitet.
Den interna organisationsstrukturen i de flesta organisationer bygger främst på arrangemang och gruppering av personal för att utföra uppgifter. En starkt hierarkisk struktur kännetecknas till exempel av ”led” där överordnade riktar sina underordnades handlingar mot företagets mål. Individer av högre rang övervakar och tilldelar uppgifter till sina underordnade. Denna struktur stödjer det primära sättet på vilket uppgifter som i slutändan bidrar till verksamhetens mål genomförs.
Vissa organisationer har avdelningar som är specifikt dedikerade till att upprätthålla och genomdriva den interna organisationsstrukturen genom att tillhandahålla ytterligare personalövervakning och genom att hålla reda på uppgifter som inte är direkt relaterade till företagets mål. En personalavdelning eller en löneavdelning, till exempel, kanske inte direkt bidrar till en fabriks produktivitet, men de hjälper till att hålla det interna organisationssystemet fungerande. Sådana avdelningar kan hantera viktiga logistiska problem så att de som är direkt engagerade i att upprätthålla eller förbättra produktiviteten för en given strävan inte distraheras av dem.
Många olika former av intern organisationsstruktur förutom hierarkisk organisation har visat sig vara ganska effektiva för att uppnå en mängd olika institutionella mål. Vissa organisationer, till exempel, är baserade på små ”team” som har en betydande grad av autonomi och som inte ständigt måste rapportera till en överordnad. Vissa tillåter till och med en stor del av personlig autonomi, även om en viss grad av ansvar nästan alltid är nödvändigt. Internet har möjliggjort utvecklingen av organisationsstrukturer som i första hand finns online. I allmänhet baseras de bästa organisationsstrukturerna i första hand på organisationens mål.