Ett beslutsstödssystem (DSS) hjälper människor att komma med ett beslut genom att ge människor rätt information och ett förslag till svar; även om detta kan vara till hjälp, finns det flera nackdelar. En av nackdelarna med beslutsstödssystem är att de kan stoppa användaren från att tänka och kan främja en kognitiv bias. Användare kan få en överbelastning av information, vilket minskar effektiviteten i beslutsfattandet. Om ett beslut går fel kan vissa användare flytta ansvaret på DSS, snarare än att skylla sig själva. DSS-program utan tillräckligt med data kan också fatta dåliga beslut, eftersom de inte helt förstår situationen.
De flesta DSS-användare är professionella chefer eller beslutsfattare som är utbildade att inte förlita sig på DSS-program, eftersom programmet endast är avsett att hjälpa till att fatta ett beslut. Vissa användare kan vara benägna att lita stort på DSS, eftersom en dator kan titta på fakta utan fördomar. Detta kan tas till det yttersta, och användare kan sluta tänka och istället välja att bara lita på datorn. Även om detta är en av nackdelarna med beslutsstödssystem, är en annan att användare kan skapa kognitiva fördomar. Till exempel kan en intuitiv och perceptiv tänkare bli alltför dömande och saklig efter att ha interagerat med en DSS.
När användare söker ett beslut från en DSS ger programmet ofta användarna information i databaser och grafer för att stödja beslutet. Normalt, om informationen är lättsmält, kommer detta att hjälpa användare att fatta välgrundade beslut, eftersom de kommer att känna till alla fakta och data som lagras i DSS-databasen. Samtidigt kan informationsöverbelastning vara en av nackdelarna med beslutsstödssystem. Om DSS tillhandahåller stora databaser som tar timmar eller dagar att läsa, så lägger användarna mer tid på att titta på fakta och försöka komma ihåg all information istället för att fatta ett beslut. Bortsett från informationsöverbelastningen kan detta minska beslutsfattandets effektivitet.
Utan en DSS kan en person som fattar ett felaktigt beslut bara skylla sig själv; detta får normalt personen att förstå vad som gick fel i beslutet, så att han bättre kan närma sig en liknande situation i framtiden. DSS-program kan kompensera detta ansvar, särskilt om användaren sätter ett ovanligt stort förtroende för programmet. Istället för att lägga skulden på sig själv kan användaren skylla på DSS. Den personliga tillväxt som kunde ha uppstått genom att förstå det dåliga beslutet kan istället resultera i att användaren lär sig att skylla på datorn för eventuella beslutsbrister.
Precis som människor behöver en DSS information för att fatta korrekta och välgrundade beslut. Om en DSS är ny eller har en liten eller felaktig databas, kan den vara benägen att bli felaktig. Om inte DSS har all specifik information som behövs för att fatta ett beslut, bör systemet inte vara fullt betrodd, eftersom alla beslut eller förslag kan vara mycket felaktiga. Detta blir en annan av de stora nackdelarna med beslutsstödssystem.