Termen flora används ofta för att täcka alla växter, svampar och alger i en given miljö, medan fauna syftar på de djur som lever där. Den vetenskapliga definitionen av flora och fauna är de växter och djur som lever i ett visst område eller en viss tid. Skillnaden mellan dem beror på om växter eller djur diskuteras.
Inom botanik, eller studiet av växter, har flora faktiskt två distinkta definitioner. För det första kan det betyda växterna i en given miljö eller tidsperiod, som listats ovan, eller det kan referera till en bok eller sådant arbete som beskriver växter i syfte att identifiera. Denna första definition är den vanligaste, och den hänvisar specifikt till de växtarter som är inhemska till område eller tid. En inhemsk art, oavsett om det är växt eller djur, är en art som har sitt ursprung i ett område och som fortsätter att växa och överleva där utan någon inblandning av människor. Motsatsen till inhemska arter är introducerade sådana.
Både flora och fauna har ytterligare klassificeringar eller underavdelningar. Floraklassificeringar beror på region, klimat, miljö och period för de växter som beskrivs. Faunaindelningarna baseras mest på var djuren lever och deras storlek.
Det finns många olika floraregioner över hela planeten. Vissa regioner kan vara så stora som hela kontinenter eller så små som en våtmark eller bergsregioner. Förutom geografiska områden kan klimat och tidsperioder gruppera olika växter i floror. Växter kan också grupperas i inhemsk, jordbruks- och trädgårds- och ogräsflora.
Det finns sju olika indelningar av fauna som används, baserat på var djuren förekommer och deras storlek. Infauna och epifauna är vattenlevande djur som lever inom eller på botten av havsbotten, respektive. Mikrofauna är mikroskopisk i storlek, medan meiofauna är något större och lever i både försäljnings- och sötvattensjordsmiljöer. Makrofauna är små jordorganismer, större än meiofauna, men mindre än daggmaskar och nematoder, som ingår i mesofaunagruppen. Megafauna är de stora djuren i den speciella miljö som diskuteras.
Både flora och fauna i en region studeras separat och tillsammans av ett antal olika typer av forskare. Botanister, eller växtforskare, studerar främst flora, medan zoologer studerar fauna. Ekologer och de som studerar naturvård tittar på båda tillsammans, eftersom de två grupperna är beroende av varandra för att överleva.