Halsont är ett vanligt symptom på allergier. Många människor kommer att uppleva en smärtsam, kliande, svullen hals samtidigt som de får en allergisk reaktion, även om sambandet mellan allergier och halsont varierar. Källan till reaktionen kan vara miljöirriterande ämnen, såsom pollen eller mögel; i dessa fall är halsontet ofta en biprodukt av nästäppa i samband med attacken. Matallergier kan också provocera fram ett svar i kroppen som leder till ont i halsen; denna typ av reaktion är vanligtvis ett direkt resultat av den allergiska reaktionen i sig.
Allergier och halsont är ofta kopplade på grund av trängseln som följer med en reaktion på miljöallergener. Många gånger är dessa säsongsbetonade allergier som hösnuva, även om andra irriterande ämnen som djurmjäll, cigarettrök eller föroreningar kan ha samma effekt. Personer med dessa typer av allergier upplever vanligtvis nästäppa, vilket i sin tur leder till att bihålorna rinner ner i halsen. Den ständiga närvaron av detta post-nasala dropp irriterar och inflammerar slemhinnan i halsen. Så länge som nästäppan kvarstår, kommer patienten vanligtvis att fortsätta ha ont i halsen; om den lämnas obehandlad kan den kroniska trafikstockningen utvecklas till infektion, vilket kan göra situationen ännu värre.
Tillsammans med post-nasalt dropp kan andra effekter av sinusstockningar uppstå från allergier och halsont kan bli resultatet. Om personen inte kan andas genom näsan kan han eller hon tvingas andas genom munnen, särskilt när han sover. Inandning av luft på detta sätt kan torka halsen och göra den öm. Överskott av slem kan också leda till hosta, vilket ytterligare kan förvärra halsen.
Matallergier och ont i halsen går också ofta ihop, men till skillnad från miljöpåverkan är det den allergiska reaktionen i sig som vanligtvis orsakar smärtan direkt. När en person äter en mat som han eller hon är allergisk mot, utvecklas antikroppar i kroppen och fäster vid celler som kallas mastceller. Nästa gång maten äts interagerar den med antikropparna på mastcellerna, vilket i sin tur stimulerar mastcellerna att avge ämnen som histamin för att attackera det upplevda hotet. Eftersom mastceller är vanliga i vävnaden i halsen, och cellerna utsätts för mat där när den sväljs, är halsont ofta ett resultat av denna typ av reaktion.