Klasifikasi ilmiah adalah sistem yang digunakan oleh ahli biologi untuk mengklasifikasikan semua kehidupan di Bumi. Ia juga dikenal sebagai klasifikasi ilmiah dalam biologi atau klasifikasi Linnean, setelah Carolus Linnaeus (1707-1778), yang pertama kali mencoba proyek besar ini. Karya perintisnya adalah Systema Naturae, pertama kali diterbitkan pada tahun 1735, yang berjalan melalui dua belas edisi sepanjang hidup Linnaeus. Versi pertama memiliki beberapa ribu entri, dikelompokkan ke dalam taksa berdasarkan karakteristik fisik bersama. Saat ini, lebih dari dua juta spesies diakui oleh sains, meskipun jumlah total spesies tumbuhan, hewan, dan uniseluler di Bumi diperkirakan antara 10 dan 100 juta.
Sistem klasifikasi ilmiah yang digunakan dalam biologi adalah hierarkis, dengan delapan tingkat kategorisasi. Bergerak dari terkecil ke terbesar, yaitu: spesies, genus, famili, ordo, kelas, filum, kingdom, dan domain. Bahkan lebih banyak divisi sering ditambahkan di antara level-level ini, karena kehidupan itu sendiri tidak memiliki kewajiban khusus untuk dikategorikan secara alami hanya dalam delapan level hierarkis. Untuk memberikan contoh masing-masing, perhatikan posisi manusia dalam klasifikasi ilmiah. Manusia adalah spesies Homo sapiens, genus Homo, famili Hominidae (kera besar), ordo Primata, kelas Mamalia (mamalia), filum Chordata (vertebrata dan beberapa kerabat dekat), kingdom Animalia (hewan), domain Eukarya (eukariota, organisme dengan sel kompleks).
Tingkat tertinggi klasifikasi ilmiah telah berubah beberapa kali selama bertahun-tahun. Pada tahun 1735, Linnaeus memperkenalkan dua kingdom: Vegetabilia (tumbuhan dan jamur) dan Animalia. Pada tahun 1866, ahli biologi Jerman Ernst Haeckel memperkenalkan kerajaan lain, Protista, untuk semua organisme uniseluler. Pada tahun 1937, ahli biologi Prancis Edouard Chatton membagi kehidupan menjadi dua “kekaisaran” – Prokariota dan Eukariota, berdasarkan pengamatan yang lebih rinci terhadap sel pada tumbuhan, hewan, dan bakteri. Ternyata tumbuhan dan hewan memiliki kesamaan mendasar dalam kompleksitas sel dan keberadaan inti seluler, sedangkan bakteri tidak memiliki inti dan organel (struktur intraseluler).
Beberapa pembaruan besar lainnya menyusul pada tahun 50-an, 60-an, dan 70-an, yang merupakan masa kemajuan pesat dalam biologi. Herbert Copeland memperbarui sistem menjadi empat kerajaan pada tahun 1956, ketika ia mengganti nama Prokariota menjadi Monera dan membagi Eukariota menjadi tiga kerajaan: Protista, Plantae, dan Animalia. Perubahan lain terjadi pada tahun 1969, ketika Robert Whittaker membagi Protista menjadi Fungi dan Protista, memberikan fungi klasifikasi tingkat atas mereka sendiri untuk pertama kalinya.
Pada tahun 1977, Carl Woese dan rekan-rekannya memperkenalkan sistem tingkat atas yang paling ramai, dengan enam kerajaan: Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, Plantae, dan Animalia. Kemudian, pada tahun 1990, sistem untungnya disederhanakan oleh Woese, dikurangi menjadi tiga domain: Bakteri, Archaea, dan Eukarya. Yang terakhir adalah sistem klasifikasi tingkat atas yang digunakan saat ini.