Pupuk organik mampu memberikan nutrisi lebih efektif untuk tanaman daripada pupuk kimia, dengan memperbaiki kondisi tanah di sekitar tanaman, dan pupuk organik yang baik harus bersertifikat untuk produksi. Nitrogen harus menjadi salah satu dari tiga bahan utama yang tercantum pada label pupuk yang tersedia secara komersial. Untuk memilih pupuk nitrogen organik terbaik, hati-hati memeriksa label untuk kandungan nitrogen yang tinggi, sertifikasi organik, dan komponen pupuk.
Pupuk kimia dapat membersihkan tanah dengan hujan dan penyiraman, menghilangkan nutrisi lain dari tanah, atau mengubah keseimbangan pH tanah. Pupuk nitrogen organik tidak hanya akan menambahkan nitrogen yang sangat dibutuhkan ke tanah yang kekurangan, tetapi juga dapat membangun struktur tanah dan memberi makan mikroba, meningkatkan retensi oksigen dan kelembaban. Tanah yang sehat menghasilkan tanaman yang lebih sehat dan juga mengurangi jumlah gulma, hama, dan penyakit yang dapat menyerang tanaman. Pupuk nitrogen organik yang baik juga akan memiliki nutrisi lain seperti kalsium dan magnesium. Pastikan untuk memeriksa bahwa tiga angka pada label pupuk berjumlah 15 atau kurang karena angka di atas 15 kemungkinan mengandung bahan kimia sintetis dan tidak benar-benar organik.
Ada dua definisi berbeda dari kata “organik” ketika memilih pupuk nitrogen organik berkualitas. Secara teknis, “organik” berarti “terikat dengan karbon” tetapi ini tidak berarti bahwa pupuk dengan label ini disetujui untuk produksi organik tanaman. Agar pupuk komersial dapat dijual untuk produksi organik, pupuk tersebut harus memiliki label yang mengidentifikasinya sebagai bersertifikat untuk penggunaan organik. Sebagian besar pusat taman dan toko perbaikan rumah harus membawa setidaknya satu jenis pupuk organik bersertifikat komersial, dan beberapa pengecer bahkan mungkin membawa pupuk organik dalam jumlah besar untuk membantu mengurangi harga.
Bahan non-komersial juga dapat membuat pupuk nitrogen organik yang sangat baik. Kotoran dan guano biasanya memiliki kandungan nitrogen yang sangat tinggi, tetapi mereka harus dibiarkan menjadi kompos sebelum digunakan karena nitrogen dapat membakar akar muda yang lunak. Tepung darah, darah bubuk dari hewan yang disembelih, juga tinggi nitrogen, bertindak sebagai pengusir hama alami, dan dapat diperoleh dari produsen daging organik. Tepung gluten jagung, tepung biji kapas, dan tepung kedelai juga merupakan pupuk nitrogen yang baik. Tergantung pada sumber daya lokal, dimungkinkan untuk mendapatkan jumlah pupuk alami ini dengan harga yang lebih baik daripada pupuk komersial, meskipun mungkin lebih sulit untuk memverifikasi sertifikasi organik dari zat-zat ini.